Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACGP22612 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms