Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms