Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC3P19447 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms