Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPAN8P19075 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN8P19075 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms