Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHCEP18577 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms