Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLT1P17948 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT1P17948 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FLT1P17948 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT1P17948 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms