Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms