Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB3P16520 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms