Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP3P12645 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms