Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CETPP11597 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CETPP11597 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CETPP11597 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CETPP11597 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CETPP11597 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CETPP11597 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CETPP11597 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms