Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms