Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00032P0C843 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms