Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFMP07197 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFMP07197 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms