Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms