Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIPP01282 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIPP01282 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIPP01282 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms