Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX58O95786 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX58O95786 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX58O95786 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX58O95786 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms