Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms