Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SURF6O75683 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SURF6O75683 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms