Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms