Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms