Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms