Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX16O60231 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms