Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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