Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms