Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms