Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBDO15205 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBDO15205 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms