Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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