Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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