Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIP1O00291 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIP1O00291 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIP1O00291 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIP1O00291 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms