Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms