Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB9F8W1W9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms