Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms