Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DSR2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4DSR2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms