Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD8B2A6NJW9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms