Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms