Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms