Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms