Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GY05 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GY05 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GY05 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V9GY05 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms