Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
R4GMQ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
R4GMQ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
R4GMQ9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms