Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms