Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms