Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms