Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms