Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms