Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms