Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms