Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms