Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms