Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAPRE3Q9UPY8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms