Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms